Федеральным законом от 19.05.2010 № 98-ФЗ Россия ратифицировала протокол от 11.12.2009 о порядке взимания косвенных налогов и механизме контроля за их уплатой при экспорте и импорте товаров в таможенном союзе Республики Беларусь, Республики Казахстан и Российской Федерации.
Установлено, что при экспорте товаров с территории одного из трех государств на территорию другого налогоплательщиком применяется нулевая ставка НДС, а также он освобождается от уплаты акцизов. Для этого в налоговый орган необходимо представить ряд документов, в том числе заявление, налоговую декларацию, договоры (контракты) по экспортируемым товарам, транспортные (товаросопроводительные) документы, выписку банка, подтверждающую фактическое поступление выручки от реализации товаров на счет налогоплательщика-экспортера. Документы подаются в налоговый орган в течение 180 календарных дней с даты отгрузки (передачи) товаров. В противном случае суммы косвенных налогов уплачиваются в бюджет с правом на вычет (зачет) соответствующих сумм НДС.
Косвенные налоги по ввозимым товарам взимаются налоговым органом того государства — члена таможенного союза, на территорию которого импортированы товары, по месту постановки на учет налогоплательщиков — собственников товаров.
Налоги (за исключением акцизов по маркируемым подакцизным товарам) уплачиваются не позднее 20-го числа месяца, следующего за месяцем принятия на учет импортированных товаров (срока платежа, предусмотренного договором (контрактом) лизинга). Акцизы по маркируемым подакцизным товарам, ввозимым в РФ, взимаются российскими таможенными органами. Декларация по косвенным налогам представляется не позднее 20-го числа месяца, следующего за месяцем принятия на учет импортированных товаров (срока платежа, предусмотренного договором (контрактом) лизинга). Форма декларации используется та, которая установлена законодательством государства, на территорию которого импортированы товары.